Communautés de communes
| Nom | Population 2007 | Nombre de communes | |
| Communauté de communes de l'Auxerrois | 61 814 | 19 | Détail |
| Communauté de communes du Sénonais | 40 416 | 9 | Détail |
| Communauté de communes Yonne Nord | 22 428 | 23 | Détail |
| Communauté de communes de l'agglomération Migennoise | 15 426 | 8 | Détail |
| Communauté de communes Gâtinais Bourgogne | 14 642 | 24 | Détail |
| Communauté de communes de Jovinien | 13 410 | 6 | Détail |
| Communauté de communes de l'Avallonnais | 12 177 | 17 | Détail |
| Communauté de communes du Tonnerrois | 10 445 | 30 | Détail |
| Communauté de communes de l'Aillantais | 9 518 | 19 | Détail |
| Communauté de communes du Florentinois | 8 802 | 6 | Détail |
| Communauté de communes du Toucycois | 8 683 | 12 | Détail |
| Communauté de communes du Pays Coulangeois | 6 764 | 11 | Détail |
| Communauté de communes entre Cure et Yonne | 5 753 | 15 | Détail |
| Communauté de communes du Canton d'Ancy-le-Franc | 5 530 | 18 | Détail |
| Communauté de communes du Chablisien | 5 081 | 12 | Détail |
| Communauté de communes de Saint-Sauveur-en-Puisaye | 4 963 | 11 | Détail |
| Communauté de communes du Canton de Bléneau | 4 702 | 7 | Détail |
| Communauté de communes d'Othe-en-Armançon | 4 502 | 12 | Détail |
| Communauté de communes du Seignelois | 4 359 | 5 | Détail |
| Communauté de communes du Vezelien | 4 298 | 18 | Détail |
| Communauté de communes de la Vallée du Serein | 4 272 | 10 | Détail |
| Communauté de communes de la Région de Charny | 3 936 | 11 | Détail |
| Communauté de communes de la Haute Vallée du Serein | 3 467 | 12 | Détail |
| Communauté de communes de la Puisaye Fargeaulaise | 3 187 | 5 | Détail |
| Communauté de communes de Forterre | 3 170 | 12 | Détail |
| Communauté de communes de la Vanne | 3 057 | 8 | Détail |
| Communauté de communes Morvan - Vauban | 2 979 | 9 | Détail |
| Communauté de communes du Pays de Coulanges-sur-Yonne | 2 743 | 8 | Détail |
| Communauté de communes de la Terre Plaine | 2 666 | 16 | Détail |
| Communauté de communes Nucérienne | 2 320 | 13 | Détail |
| Communauté de communes des Coteaux de la Chanteraine | 1 226 | 3 | Détail |
Communes membres d'aucun groupement
| Nom | Population 2007 |
| Villeneuve-sur-Yonne | 5 404 |
| Brienon-sur-Armançon | 3 071 |
| Saint-Julien-du-Sault | 2 347 |
| Héry | 1 739 |
| Véron | 1 647 |
| Soucy | 1 339 |
| Cézy | 1 038 |
| Lindry | 950 |
| Cerisiers | 900 |
| Venizy | 821 |
| Dixmont | 807 |
| La Celle-Saint-Cyr | 793 |
| Champlost | 766 |
| Étigny | 713 |
| Marsangy | 692 |
| Escolives-Sainte-Camille | 679 |
| Chamvres | 643 |
| Chailley | 609 |
| Brion | 600 |
| Saint-Denis | 594 |
| Arces-Dilo | 593 |
| Saligny | 584 |
| La Ferté-Loupière | 561 |
| Theil-sur-Vanne | 542 |
| Armeau | 533 |
| Collemiers | 522 |
| Chaumot | 503 |
| Fontaine-la-Gaillarde | 489 |
| Vaudeurs | 473 |
| Précy-sur-Vrin | 455 |
| Courgenay | 446 |
| Bellechaume | 441 |
| Les Bordes | 430 |
| Noé | 427 |
| Dannemoine | 416 |
| Saint-Maurice-aux-Riches-Hommes | 392 |
| Saint-Aubin-sur-Yonne | 387 |
| Sépeaux | 385 |
| Rousson | 381 |
| Nitry | 371 |
| Villevallier | 368 |
| Villiers-Louis | 367 |
| Hauterive | 347 |
| Voisines | 342 |
| Esnon | 338 |
| Malay-le-Petit | 334 |
| Verlin | 325 |
| Molinons | 315 |
| Bussy-le-Repos | 313 |
| Passy | 301 |
| Saint-Martin-d'Ordon | 297 |
| Boeurs-en-Othe | 293 |
| Vincelottes | 290 |
| Paroy-sur-Tholon | 283 |
| Cudot | 273 |
| Vaumort | 267 |
| Cheney | 264 |
| Précy-le-Sec | 238 |
| Saint-Loup-d'Ordon | 212 |
| Lailly | 188 |
| Pont-sur-Vanne | 184 |
| Paroy-en-Othe | 163 |
| Coulours | 158 |
| Saint-Romain-le-Preux | 153 |
| Villechétive | 149 |
| Fournaudin | 131 |
| Flacy | 117 |
| Mercy | 74 |
| Cérilly | 54 |