Communautés d'agglomération
| Nom | Population 2007 | Nombre de communes | |
| Communauté d'agglomération du Grand Dôle | 52 019 | 41 | Détail |
Communautés de communes
| Nom | Population 2007 | Nombre de communes | |
| Communauté de communes du Bassin Lédonien | 31 461 | 22 | Détail |
| Communauté de communes Ain - Angillon - Malvaux | 18 579 | 38 | Détail |
| Communauté de communes du Val de Bienne | 15 474 | 13 | Détail |
| Communauté de communes du Comté de Grimont | 9 712 | 27 | Détail |
| Communauté de communes du Jura Nord | 9 358 | 25 | Détail |
| Communauté de communes du Haut Jura | 8 927 | 4 | Détail |
| Communauté de communes du Val d'Amour | 8 878 | 24 | Détail |
| Communauté de communes de la Plaine Jurassienne | 8 862 | 21 | Détail |
| Communauté de communes du Jura Sud | 7 142 | 17 | Détail |
| Communauté de communes Petite Montagne | 6 614 | 40 | Détail |
| Communauté de communes Arbois, Vignes et Villages - Pays de Louis Pasteur | 6 306 | 14 | Détail |
| Communauté de communes de la Station des Rousses | 6 170 | 4 | Détail |
| Communauté de communes du Sud Revermont | 6 127 | 19 | Détail |
| Communauté de communes la Bletteranoise | 6 126 | 12 | Détail |
| Communauté de communes du Pays de Salins-les-Bains | 6 049 | 22 | Détail |
| Communauté de communes des Coteaux de la Haute Seille | 5 888 | 18 | Détail |
| Communauté de communes du Pays des Lacs | 5 861 | 30 | Détail |
| Communauté de communes du Plateau de Lizon | 5 832 | 7 | Détail |
| Communauté de communes de la Région d'Orgelet | 5 052 | 25 | Détail |
| Communauté de communes de la Granvalličre | 4 958 | 11 | Détail |
| Communauté de communes du Pays de Saint-Amour | 3 891 | 12 | Détail |
| Communauté de communes du Val de Brenne | 3 304 | 19 | Détail |
| Communauté de communes du Plateau de Nozeroy | 3 136 | 28 | Détail |
| Communauté de communes du Val de Sorne | 2 938 | 9 | Détail |
| Communauté de communes du Nord-Ouest Jura | 2 629 | 11 | Détail |
| Communauté de communes des Hautes Combes du Jura | 1 983 | 7 | Détail |
| Communauté de communes du Premier Plateau | 1 669 | 8 | Détail |
| Communauté de communes des Foulletons | 1 502 | 4 | Détail |
Communes membres d'aucun groupement
| Nom | Population 2007 |
| Bellefontaine | 453 |
| La Mouille | 287 |
| Villeneuve-sous-Pymont | 217 |
| Champagney | 216 |
| Vers-sous-Selličres | 158 |
| Val-d'Épy | 134 |
| Auxange | 132 |
| Villard-sur-Bienne | 132 |
| Saint-Lamain | 120 |
| Plumont | 90 |
| Froideville | 51 |
| Senaud | 39 |